根据《中华人民共和国注册会计师法》的相关规定，企业聘请注册会计师事务所进行审计服务时，其收费应当合理，并根据受审计企业的经济规模、数量、复杂程度等因素确定。

一般来说，厦门高新企业的审计费用与以下几个方面有关：

1. 被审计企业的规模和特点：不同规模的企业在经济活动、账目繁杂程度以及其他方面存在差别，审计难度也不同，因此审计费用也会略有出入。

2. 审计服务年限：企业需要进行长期稳健的经营，而连续多年使用同一家审计机构，则往往可获得一定的优惠。

3. 行业特殊性：某些行业（如金融、保险等）具有较高的风险和准入门槛，对审计工作提出了更高的要求，因此审计费用相对较高。

4. 审计内容和工作量：审计对象和审计内容包括年度财务报表审核、税务证明、控制环境评估、内部审计、管理咨询等，不同的项目工作量差别，在费用上也会有所区别。

总之，每个企业的情况都不完全相同，因此审计费用是具体问题具体分析的结果。受审计机构在出具审计服务合同前会向客户提供报价，如有质疑，可与受审计机构进行协商。建议高新企业在选择审计机构时，加强比较，对多家注册会计师事务所的技术实力、经验和服务水平等作出全面评估，并选择适合自己的审计服务机构。